La fundación Andrés Jofre Ferrer es una entidad privada de interés cultural y sin ánimo de lucro. Pertenece a la familia Jofre y está gestionada por ellos mismos. El museo se financia a través de la venta de entradas de los visitantes, de la venta de productos de la tienda, de la gestión de visitas culturales, de grupos y excursionistas, así como de la realización de exposiciones, conferencias y otras actividades de carácter lúdico.
Para ello la fundación necesita patrocinios y colaboradores. En la actualidad son los siguientes:
- Govern de les Illes Balears
- Consell Insular de Mallorca
- Ajuntament de Alcudia
- Caixa Bank